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适用于大豆疫霉菌遗传分析的新EST-SSR标记
大豆疫霉菌 表达序列标签（EST） SSR标记 通用性
2009/2/28
【目的】开发大豆疫霉菌SSR标记，为深入了解大豆疫霉菌遗传变异提供理想分析工具。【方法】用SSRIT软件对28 197条大豆疫霉菌EST进行SSR搜索，选择含有SSR的合适EST设计、合成引物和PCR扩增。【结果】发现1 454条EST含有SSR，其中3个碱基重复基元类型最多，有855个，占鉴定总数的54.3%。设计合成140对引物，用10个大豆疫霉菌菌株基因组DNA进行PCR检测，有111对引物...
利用SSR标记分析山东省花生区试品种的遗传多样性特点
花生 SSR标记 遗传多样性 聚类分析
2009/1/5
利用SSR标记对山东省花生区试品种进行遗传多样性分析，以参加国家北方区试的17份省外花生品种为对照。结果表明，10对SSR引物在45份花生品种共扩增出57条带，其中45条呈现多态，多态性比率为78.95%。引物的多态性信息含量（PIC）变幅为0.369～0.857，平均值为0.683。多样性指数比较表明，山东省的基因多样性指数H（0.2476）和Shannon指数I（0.3723）均低于河南省（0...
一个水稻落粒性基因SH1的SSR标记定位
水稻 SSR标记 落粒性基因 分子标记辅助选择
2009/1/4
以籼稻品种93-11为轮回亲本，与粳稻品种日本晴杂交并回交的高世代分离群体为研究材料，选用104个多态性的SSR标记对水稻的落粒性基因进行定位。结果表明，在BC4F2群体中，6个标记的基因型来自于日本晴；在BC4F3定位群体中，难落粒植株数与易落粒植株数的分离比例为3:1，落粒性受1对显性基因控制，命名为SH1；分子标记与落粒性共分离分析将SH1定位在SSR标记RM5389和RM1068、RM13...
山东省不同年代栽培大豆SSR标记遗传多样性分析
遗传多样性 山东大豆 SSR
2008/12/31
从分子水平探讨山东省大豆种质资源遗传多样性,为山东大豆今后的大豆育种和遗传改良奠定基础;对山东省36份不同年代材料进行SSR标记,计算遗传相似系数,并对供试品种进行UPGMA聚类分析;20对SSR引物共扩增出138个等位变异,平均每对引物扩增出6.9个等位变异.遗传相似系数的变化范围为0.66～0.97,总体平均值为0.78;相似系数大,品种间遗传差异较小.利用SSR标记的数据结果,对供试品种进行...
玉米温-热种质杂交后代选系遗传结构的SSR标记分析
玉米 遗传结构 微卫星标记
2008/12/31
利用SSR标记技术，对温热种质5003×A19杂交F6、F7后代性状基本稳定的22个选系遗传结构（变异）进行了初步研究。从88对SSR引物中，筛选出48对表现多态性丰富、带型清晰明显且稳定的引物，分析了22个选系的遗传多样性及遗传结构，并对其应用前景进行了探讨。根据SSR标记结果，用UPGMA法进行聚类分析表明，双亲及其杂交后代全部选系与标准测验种478、B73属于同一个杂种优势群-PA群，玉米温...
水稻同核异质不育系及其保持系核基因组的SSR分析
水稻 同核异质不育系 保持系 微卫星标记
2008/12/10
以4套共15份同核异质水稻雄性不育系和保持系为试验材料，应用随机分布于水稻12条染色体上的42对SSR引物，分析其核基因组的遗传多样性和亲缘关系。 在15份材料间共检测到63个等位基因，多态性位点百分率为4048%,平均每个位点的等位基因数为1.5个，平均基因多样性为0.18。4套同核异质不育系的平均相同位点为54.5个，占总等位基因数的86.51%，差异位点为8.5个，占13.49%。同核异质...
Recent advances in genomic technologies have generated a large number of expressed sequence tags (ESTs) in cotton. Many of these ESTs are available in public databases, which offer an opportunity to i...
甬优系列杂交水稻SSR标记指纹图谱和籼粳属性
杂交水稻 微卫星标记 指纹图谱 籼粳分类
2008/12/8
用22个SSR分子标记对13份甬优系列杂交水稻组合及其亲本材料和6份籼粳对照种进行分析，共获得87个等位基因，每对引物扩增的等位基因数为2~8个。所有供试材料间均检测到了差异，从而建立起甬优1号~甬优6号杂交水稻组合及其亲本的DNA指纹图谱。聚类分析结果表明，9份供试材料与3份粳稻对照种聚于一类，属粳稻；4份供试材料与籼稻对照种IR36聚于一类，属籼稻。这与形态分类结果基本一致。从分子水平确认了...
3个小麦重组自交系群体抗赤霉病QTLs的SSR分析
小麦 赤霉病抗性 重组自交系群体 SSR标记
2008/10/27
对3个重组自交系群体(RILs)苏麦3号/Alondra F_7、望水白/Alondra F_8、894037/Alondra F_8进行SSR分析,用单个标记方差及回归分析方法,结合接种鉴定资料,寻找与抗赤霉病性有关的的SSR分子标记。结果显示,在这3个抗病亲本的3B染色体上都存在一个主效抗赤霉病QTL,分别能解释2.6％～6.7％(苏麦3号)、47.4％(894037)、8.9％～27.0％(...
利用SSR、ISSR标记技术分析了3个甘蓝型油菜自交不亲和系及22个不同来源的父本品种的遗传多样性,及其与这些亲本按NCII法配制杂种的产量性状表现及杂种优势的关系。结果表明,基于遗传距离的UPGMA(非加权类平均法)聚类法可将25个亲本材料分为6组,SI-1300、SI-1320各为一组,来源于中国的2个父本品种为一组,SI-1310与来源于国外的其它品种分属另3组。这种分组结果与材料的来源及系...
【目的】系统分析不同小麦种的细胞质基因组遗传差异，用以发掘和利用新的小麦种质资源。【方法】采用24个叶绿体基因组微卫星分子标记，对普通小麦（Triticum aestivum L.）、斯卑尔脱小麦（Triticum spelta L.）、密穗小麦（Triticum compactum Host.）和中国特有小麦（新疆稻麦T. petropavlavskyi、西藏半野生小麦T. tibetanum和...
陆地棉不同纤维发育突变体及其SSR指纹分析
光子棉 SSR标记 指纹图 聚类分析
2008/9/22
本研究对3组不同纤维发育突变体的近等基因系，利用SSR分子标记技术，进行了多态性分析及遗传相似性和聚类分析。3组近等基因系分别是：（1）陆地棉遗传标准系TM-1、无绒有絮突变体光子Nn、光子nn、H-154（n2）和毛子NN2-2；（2）无绒无絮突变体徐州142无絮和徐州142；（3）无绒无絮突变体新乡小吉无絮可能是中棉所12或豫棉4号的突变体。本文SSR分子标记和形态学鉴定表明新乡小吉无絮可能来...
棉花γ射线诱变后代的SSR标记遗传多样性
棉花 SSR标记 辐射 遗传多样性
2008/9/19
利用39个多态性SSR标记分析了三个棉花品种辐射诱变后代M5材料（共74份）的遗传多样性。结果表明，三个品种各检测到的多态性位点占总个多态性位点的百分数分别为51.3%、48.7%和66.7%；且其基因型多样性（H'）的平均值分别为0.997、0.648、1.187。三个品种诱变后代材料与其未辐射处理对照的遗传相似系数变幅分别为0.6515～0.9697、0.6970～1.0000、0.5524～...