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为加强QSAR/Read across计算毒理学的学术交流,稳步推进计算毒理学工具在化学物质毒性判定中的合理应用,有效提升结构-效应关系对毒物毒性预测的准确性,中国毒理学会工业毒理学专业委员会风险评估学组第二届学术沙龙活动暨QSAR/Read across计算毒理学沙龙于2015年10月28日至29日在湖北省咸宁市召开。会议由中国毒理学会工业毒理学专业委员会主办,湖北省疾病预防控制中心协办。
喹啉酮类小分子p53-MDM2结合抑制剂3D-QSAR研究
p53-MDM2 结合抑制剂 异喹啉酮
2013/12/2
设计、合成高活性的小分子p53-MDM2结合抑制剂,建立具有预测能力的3D-QSAR模型。方法 采用分子模拟软件Sybyl,利用比较分子场方法(CoMFA)、比较分子相似性指数法(CoMSIA),选择已报道的具有p53-MDM2结合抑制活性的一类有相同母核的21个异喹啉酮衍生物作为训练集,7个作为预测集进行3D-QSAR模型的建立和验证。结果 模型具有较高q2(q2CoMFA=0.545,q2Co...
3-甲基芬太尼衍生物QSAR研究
芬太尼衍生物 3-甲基芬太尼 镇痛活性 分配系敛(logP) 疏水常数(π) 克分子折射率(MR)
2009/12/28
Hansch途径研究了一系列3-甲基芬太尼衍生物理化性质与镇痛活性间的关系。初步结果表明,镇痛活性与化合物的油/水分配系数之间无规律性变化;与R2取代基的立体效应(如L,B1~B4及MRR2)和疏水常数(πR2)间有一定的匹配关系,与R3取代基的Hammen常数(σ)呈抛物线型。引入1-β羟基亦颇为有利。从作用机理推测,该类衍生物的R2和可能是与受体相结合的基团,R1可能仅起药物转运的载体作用,1...
为了建立一种新型氨基酸结构描述子并用于多肽定量构效关系研究,本研究从天然氨基酸150个radial distribution function (RDF)指数经主成分分析得出一种新3D氨基酸描述子-SVRDF(principal component scores vector of radial distribution function),应用该描述子并通过偏最小二乘(PLS)对苦味二肽、催产素...
As a therapeutic target, protein tyrosine phosphatase 1B (PTP1B) has received considerable attention for the treatment of diabetes mellitus. A QSAR study using substituted monocyclic and polycyclic th...
苯酚类抗癌药的药效机制及其QSAR研究
酚类化合物 抗癌活性 定量构效关系 EHMO法
2008/10/24
背景与目的: 酚类化合物抗癌研究近年来受到重视。该类化合物对癌细胞有选择性杀伤作用,其抗癌活性与酚氧化成醌的难易程度相关。材料与方法:本文将量子化学中扩展的Hückel分子轨道法和计算机模式识别法相结合,研究酚类及其衍生物的定量构效关系(QSAR),探寻该类化合物的量子化学特征参数,采用逐步回归法得到其Hansch方程。结果:分析活性部位和药效大小,结论:说明在邻对位与间位引入强供电子基则生物活性...
目的建立一套新型的氨基酸残基结构描述符,用此描述符进行多肽的定量构效关系研究。方法通过理论计算得出167个氨基酸结构描述参数,再对167个参数进行主成分分析,从中提取出与氨基酸残基的三维结构性质密切相关的三个结构描述参数c1,c2,c3-scales。然后采用G/PLS算法,建立氨基酸残基结构描述符c-scales与多肽生物活性之间的函数关系,确定多肽的QSAR模型。结果用此方法建立的苦味二肽、A...
3-甲基芬太尼衍生物立体异构体的QSAR研究
3-甲基芬太尼衍生物 立体异构体 镇痛活性 CoMFA 量子化学计算(AM1) PLS QSAR
2010/3/1
用比较分子力场分析(CoMFA)方法研究了3-甲基芬太尼和羟甲芬太尼立体异构体的三维定量构效关系(3D-QSAR)。所得CoMFA-QSAR模型有很好的预测能力(γ2cros-validated=0.716,noptimalcomponent=5,γ2conventional=0.999,s=0.052,F=1305.1),模型中,被研究化合物的构象可能就是其活性构象。以AM1方法进行量子化学计算...
氢醌类化合物抗菌活性的QSAR研究
构效关系 氢醌类 抗菌活性 HMO方法
2010/3/19
本文用Topliss,Free-Wilson和Hansch方法对氢醌类化合物的抗菌活性进行了QSAR研究。取代氢醌的抗菌活性可能是通过药物与受体间的电子转移所生成的电荷转移复合物而实现的。在Hansch分析中,应用了表征药物与受体间化学反应性的量子化学参数LEMO。三种方法配合取得了一致的良好结果。
用分子连接性的方法建立了柱晶白霉素类、林可霉素类和林大霉素类的QSAR方程式。柱晶白霉素衍生物的体外抗菌活性随一阶价分子连接值的增加与大环内酯3-羟基酯基的除去而增加。在25个NCH3和NC2H5林可霉素衍生物中,计算体外抗藤黄八迭球菌的最适一阶价分子连接值(1XvO)分别为11.7583与12.2394,林大霉素类最适1(XvO)为11.3604。本文与Martin对该三类衍生物所建立的Hans...
用分子连接性的方法建立了中枢神经系统抑制剂2-咪唑烷酮类衍生物的定量构效关系方程式,并和文献发表的Hansch法进行对比,本文建立的方程式远比Eric等建立的方程式为好。此外,作者还探讨了影响活性大小的定量结构因素。