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广东省农业科学院果树研究所首次利用自主构建的荔枝cDNA文库、转录组数据库、基因组测序及重测序数据库，大规模开发荔枝EST-SSR和SNP分子标记，并成功应用于荔枝育种领域，率先建立起荔枝EST-SSR与SNP分子标记辅助育种技术平台，创建了广东省荔枝分子标签工程技术研究中心，相关科技成果获2019年度广东省科学技术进步奖二等奖。
基于HRM获得与桃Tssd紧密连锁的SNP标记
桃 高分辨率熔解曲线 SNP基因分型 温度敏感半矮生型
2017/11/14
植物中，SNP标记具有分布广泛、分辨率高、共显性和多态性高等特点，是遗传研究的常用分子标记。桃全基因组测序完成，获得了大量SNP位点。利用现有的SNP数据进行简单、快速的SNP基因分型是基因定位、品种鉴定和图谱构建等后续研究的基础。文章拟建立采用高分辨率熔解曲线进行不同类型SNP的基因分型方法，以获得与桃温度敏感半矮生型基因紧密连锁的分子标记。【方法】以普通生长型（ST）单株97-32-46为母本...
以207株‘金冠’与‘富士’苹果的F1杂交分离群体实生树为试材，挑选抗炭疽菌叶枯病基因Rgls位点区域内的，第15条染色体上，位于SSR标记S0304673和S0405127之间500 kb物理距离内，由全基因组重测序技术所获得的与抗该病相关的10个SNP及10个InDel标记，通过高分辨率熔解曲线（High Resolution Melting，HRM）技术筛选出与基因Rgls位点紧密连锁的2个...
葡萄SNP 标记的CAPS 和TSP 分析
葡萄 单核苷酸多态性 酶切扩增多态性序列 温度转变PCR
2013/11/30
为了建立起葡萄SNP 标记分析的一般方法和探索EST-SNP 标记在葡萄中的应用，对前期开发的葡萄EST-SNP 位点进行了筛选，设计了28 对CAPS（cleaved amplified polymorphic sequences，酶切扩增多态性序列）标记引物和22 对TSP（Temperature-switch PCR，温度转变PCR）标记引物，并在31份葡萄材料中进行了分析，其中20 对CA...
两种SNP分型方法的比较及其在柚品种鉴定中的应用
柚 单核苷酸多态性 等位基因特异性PCR 高分辨率熔解曲线分析 基因分型
2013/9/7
用两种常用的SNP分型方法，等位基因特异性PCR法（Allele-specific PCR，AS-PCR）和高分辨率熔解曲线分析（High resolution melting analysis，HRMA），对16个柚栽培品种和8个柚杂种后代材料进行了7个SNP位点的分型研究。结果表明这两种方法所得的分型结果相同，都将24个样本分成了22种基因型。值得一提的是，样本‘八朔’与‘红八朔’，‘红甘夏’...