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本发明公开了一种与莲根状茎膨大性状主效QTL紧密连锁的SNP分子标记及其应用，所述主效QTL位点位于1号连锁群；其区间范围为10.430cM～11.043cM；所述主效QTL位点连锁的SNP分子标记为3个，分别为SNP1～SNP3，其核苷酸序列如SEQIDNO：1～3；其中，各标记序列中第251位碱基均为多态性位点，所述分子标记SNP1～SNP3的多态性位点分别为T/C、C/T、T/G。本发明首次...
中国林业科学研究院热带林业研究所专利：用于鉴定油茶品种的SNP分子标记及其应用
中国林科院热林所 专利 油茶品种 SNP分子标记
2023/11/16
中国林业科学研究院热带林业研究所专利：用于鉴定油茶品种的SNP分子标记及其应用。
中国农业科学院果树研究所专利：与葡萄酯类香气物质含量相关的SNP分子标记及其应用。
近日，山东省农业科学院蔬菜研究所鳞茎类蔬菜育种与栽培创新团队洋葱课题组在Frontiers in Plant Science（IF=6.627；JCR1区，中科院2区）发表了题为“Construction of a high-resolution genetic map and identification of single nucleotide polymorphism markers rel...
江西省农业科学院蔬菜花卉研究所成果：辣椒熟性SNP分子标记及其应用
辣椒 SNP 分子标记
2023/3/31
本发明公开了辣椒熟性SNP分子标记及其应用，利用本发明提供的分子标记及其扩增引物，结合特定的限制性内切酶处理，可在子叶期快速、准确筛选出特早熟辣椒，实现辣椒熟性育种的分子标记辅助选择，提高育种选择效率，在辣椒熟性育种中具有重要应用价值。专利号：ZL201810555673.1
近日，中国农业科学院茶叶研究所茶树遗传育种团队基于“龙井43”基因组参考序列和茶树重测序数据，开发出一款200K茶树SNP芯片。相关研究成果在《植物生物技术杂志（Plant Biotechnology Journal）》上发表。
中国农业科学院茶叶研究所开发出首款茶树高密度SNP芯片（图）
中国农业科学院茶叶研究所 茶树 高密度 SNP芯片
2021/12/17
近日，中国农业科学院茶叶研究所茶树遗传育种团队基于‘龙井43’基因组参考序列和茶树重测序数据，开发出一款200K茶树SNP芯片。该芯片是首款茶树高密度SNP芯片，以‘龙井43’（♀）和‘白毫早’（♂）F1群体为材料，该芯片能够将18226个SNP位点绘入图谱，获得5325个bin-marker，连锁图谱总长度为2107.01cM，相邻标记平均遗传图距为0.39cM，构建了目前遗传密度最高的连锁图谱...
广东省农业科学院果树研究所首次利用自主构建的荔枝cDNA文库、转录组数据库、基因组测序及重测序数据库，大规模开发荔枝EST-SSR和SNP分子标记，并成功应用于荔枝育种领域，率先建立起荔枝EST-SSR与SNP分子标记辅助育种技术平台，创建了广东省荔枝分子标签工程技术研究中心，相关科技成果获2019年度广东省科学技术进步奖二等奖。
对保存在国家种质武汉水生蔬菜资源圃内来自国内外不同地区的19 份豆瓣菜种质资源的8 个农艺性状进行调查分析，并利用SLAF-seq 技术对豆瓣菜种质资源进行简化基因组测序，研究其遗传多样性。结果表明：质量性状（叶色、茎色、顶端小叶形状）变异不明显；数量性状（顶端小叶长、顶端小叶宽、株高、茎粗、叶柄长）变异系数较低（7.69%～16.45%），说明数量性状的变异范围较窄，但仍存在具有优良性状的资源，...
切花菊耐寒性相关SNP位点挖掘与候选基因分析
菊花 耐寒性 全基因组关联分析 候选基因
2019/12/17
以58份切花菊为试验材料，调查了脚芽期、现蕾期和盛花期叶片以及盛花期舌状花低温半致死温度（LT50），利用全基因组关联分析挖掘耐寒性相关优异等位变异和候选基因。结果表明，切花菊品种不同时期叶片或盛花期舌状花耐寒性变异较大，变异系数均大于25%；通过主效可加互作可乘（AMMI）模型的双标图分析筛选出抗寒性强且稳定性较好的品种‘天使’。基于36 737个高质量SNP位点和混合线性模型的关联分析，共挖掘...
利用萝卜Ogura-CMS 保持系和恢复系育性恢复基因Rfo 的序列，开发了基于高通量竞争性
等位基因特异性PCR（KASP）分型技术的SNP 标记：Rfo-SNP1。利用该标记对24 个萝卜品种的304 个
单株进行了育性恢复基因Rfo 的基因型鉴定，其中289 株获得基因分型结果，占整个群体的95.07%。从
分型结果看，育性恢复基因Rfo 的基因型为rfrf 的有110 株（占36.1...
基于HRM获得与桃Tssd紧密连锁的SNP标记
桃 高分辨率熔解曲线 SNP基因分型 温度敏感半矮生型
2017/11/14
植物中，SNP标记具有分布广泛、分辨率高、共显性和多态性高等特点，是遗传研究的常用分子标记。桃全基因组测序完成，获得了大量SNP位点。利用现有的SNP数据进行简单、快速的SNP基因分型是基因定位、品种鉴定和图谱构建等后续研究的基础。文章拟建立采用高分辨率熔解曲线进行不同类型SNP的基因分型方法，以获得与桃温度敏感半矮生型基因紧密连锁的分子标记。【方法】以普通生长型（ST）单株97-32-46为母本...
以207株‘金冠’与‘富士’苹果的F1杂交分离群体实生树为试材，挑选抗炭疽菌叶枯病基因Rgls位点区域内的，第15条染色体上，位于SSR标记S0304673和S0405127之间500 kb物理距离内，由全基因组重测序技术所获得的与抗该病相关的10个SNP及10个InDel标记，通过高分辨率熔解曲线（High Resolution Melting，HRM）技术筛选出与基因Rgls位点紧密连锁的2个...
葡萄SNP 标记的CAPS 和TSP 分析
葡萄 单核苷酸多态性 酶切扩增多态性序列 温度转变PCR
2013/11/30
为了建立起葡萄SNP 标记分析的一般方法和探索EST-SNP 标记在葡萄中的应用，对前期开发的葡萄EST-SNP 位点进行了筛选，设计了28 对CAPS（cleaved amplified polymorphic sequences，酶切扩增多态性序列）标记引物和22 对TSP（Temperature-switch PCR，温度转变PCR）标记引物，并在31份葡萄材料中进行了分析，其中20 对CA...