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北京市农林科学院草业花卉与景观生态研究所在百合属DNA条形码开发方面取得新进展（图）
百合属 DNA 条形码 种质资源
2022/1/25
2021年10月，北京市农林科学院草业花卉与景观生态研究所在国际植物学期刊BMC Plant Biology (IF=4.215) 上发表了题为Developing an efficient DNA barcoding system to differentiate between Lilium species的研究论文。文章开发了百合属高效可靠的DNA条形码，为百合属资源的分类、鉴定、种质资源的...
为了解花生清蛋白的生物学活性,本试验采用硫酸铵沉淀法初步分离花生种子中的花生清蛋白,并用DEAE-52柱纯化得到花生清蛋白,分析其体外抗氧化性及DNA酶活性。结果表明,65%硫酸铵分离花生清蛋白效果最好;纯化后的花生清蛋白由3个亚基组成,其相对分子质量分别为14.5、15.5、17.2 kDa。花生清蛋白体外抗氧化活性较高,对DPPH自由基和羟基自由基的清除率与花生清蛋白浓度呈正相关,清蛋白浓度从...
以杏黄兜兰（Paphiopedilum armeniacum）成熟叶片为试材，采用CTAB法、改良CTAB法、高盐低pH法和SDS法提取总DNA，用琼脂糖凝胶电泳和分光光度计法分别检测所得总DNA的完整性和纯度，以期获得杏黄兜兰基因组DNA的高质量提取方法。结果表明：应用CTAB法和高盐低pH法提取的DNA降解严重、完整性差，纯度低；SDS法提取的DNA虽完整性较好，但蛋白质污染严重，纯度低；改良...
红富士苹果芽变系DNA甲基化研究
富士苹果 着色系芽变 DNA甲基化 甲基化敏感扩增多态性 表观遗传变异
2019/3/5
以35份富士苹果（Malus × domestica Borkh.‘Fuji’）芽变材料为试材，利用甲基化敏感扩增多态性（Methylation Sensitive Amplified Polymorphism，MSAP）分析和UPGMA聚类方法，对其基因组甲基化修饰水平、变异模式以及表观遗传变异关系进行研究。结果表明：（1）不同富士系得到不同的MSAP扩增，总DNA甲基化水平27.90% ~ 3...
选取5个叶绿体DNA非编码区trnL-trnF-1、trnL-trnF-2、trnS-psbC、accD-psaI、rps16-trnQ和1个基因区域rbcL，对中国秦岭淮河以南地区的梨（Pyrus L.）资源进行遗传多样性和演化分析。将188份梨资源的测序结果整合得到长度为5 612 bp（包含缺失片段），共检测出13个单倍型、4个单一突变位点、16个简约性信息位点和14个插入/缺失片段（InD...
番茄黄化曲叶病毒抗性检测DNA提取方法的优化及应用
番茄 黄化曲叶病毒 DNA
2018/4/24
通过对传统DNA 提取方法进行优化和改进，得到一种快速提取番茄DNA 的方法。综合比较改进法、商品化试剂盒（经典法）和其他试剂盒（快速法）提取番茄DNA 的效果。结果表明：改进法相比经典法提取的DNA 质量稍有差别，但用时较少，完全可以满足后续PCR 试验要求，尤其适用于番茄黄化曲叶病毒的大规模抗性检测；同时该法无液氮及其他有毒溶剂的加入，不仅节省了试验时间和试验成本，而且大大降低了试验的危险性。
一种快速提取南瓜大群体基因组DNA 的方法
南瓜 基因型鉴定 分子育种 碱煮法
2018/4/19
基因型鉴定是作物分子标记辅助育种和基因功能遗传分析中十分重要的环节，此项技术的应用正日渐频繁，因而迫切需要一种高通量筛选的方法。本试验以南瓜中筛选到的互补型SSR 引物为验证手段，在种子阶段比较了钻孔法和萌芽法采用碱煮法提取DNA 的效果，并且在成熟植株阶段验证了各组织部位采用碱煮法提取DNA 的效果。结果表明：使用萌芽的南瓜种子根尖以碱煮法提取DNA 是可用于种子纯度测定的快速方法；成熟植株各部...
近日，植物科学TOP期刊Plant Biotechnology Journal（IF=7.443）在线发表了我校园艺学院旱区作物逆境生物学国家重点实验室苹果逆境生物学团队的论文 “Single-Base Methylome Analysis Reveals Dynamic Epigenomic Differences Associated with Water Deficit in Apple”。...
DNA序列拷贝数变化决定黄瓜性别
DNA序列 拷贝数变化 黄瓜性别
2015/5/27
近日，记者从中国农业科学院蔬菜花卉研究所获悉，该所蔬菜功能基因组学创新团队与国内外同行合作，发现一个大片段DNA序列拷贝数变化可以决定黄瓜的性别。相关成果于2015年5月22日在《植物细胞》上发表。大片段DNA序列的结构变异（SV）包括插入/缺失、拷贝数变化和倒位等多种类型，可引起许多人类疾病（如自闭症和精神分裂症）的发生，在植物中也有关于结构变异引起农艺性状（如叶子大小和果实形状）改变的少量报道...
Fingerprinting of Vaccinium corymbosum cultivars using DNA of fruits
molecular markers blueberry fruits and leaves characterization
2015/3/24
In recent years the production and consumption Vaccinium corymbosum has increased. Highbush blueberry cultivars are divided into three types, northern, intermediate and southern. The traditional metho...
An analysis of apricot cultivars by random amplified polymorphic DNA and microsatellite primers
Prunus armeniaca L. microsatellites
2015/3/4
The random amplified polymorphic DNA (RAPD) technique and microsatellites were used to study the genetic diversity
and to identify cultivars within a collection of 95 cultivars of Prunus armeniaca L...
DNA polymorphism in genetic resources of red pepper using microsatellite markers
pepper genetic resources microsatellites SSRs variability
2015/1/28
Genetic variability among 41 accessions of red pepper (Capsicum annuum L.) was assessed using eight microsatellite markers. Three of the microsatellite markers (Hpms 1-1, Hpms 1-168, and Hpms 1-274) h...
从苹果属腊叶标本中提取DNA的改良CTAB法研究
腊叶标本 改良 DNA
2014/4/6
为了探求从保存年代较长并富含多糖多酚的苹果属植物腊叶标本中提取基因组DNA的方法，在传统CTAB法的基础上加以改良，无液氮研磨材料后加入预冷CTAB free缓冲液和提高沉淀时盐浓度，所得模板直接用于扩增nrITS区和cpDNA matK基因。经紫外分光光度和琼脂糖凝胶电泳检测，结果表明用改良方法提取的DNA在质量和产量上优于常规方法并能满足后续扩增反应的要求。该方法不需要液氮研磨，节省了人力和成...
阿魏蘑的DNA指纹分析与鉴定
阿魏蘑 DNA指纹分析 鉴定
2011/8/30
为及时制止阿魏蘑菌株混乱现象的产生，对国内现有的11株栽培常用的阿魏蘑菌株进行DNA指纹分析；以RAPD、ISSR、SRAP多态性分析的方法为主，用筛选出来的8条RAPD、ISSR、SRAP引物共扩增出116个较为清晰的DNA条带，然后进行聚类分析；结果表明，可将11个供试菌株分为四个群体：类Ⅰ：包括Pl. f 0007；类Ⅱ：包括Pl. f 0002；类Ⅲ：包括Pl. f 0003；类Ⅳ：包括余...