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2023年2月8日，PNAS发表了中国科学院上海有机化学研究所王婧研究员、俞飚院士研究团队、房鹏飞研究员、上海交通大学医学院附属仁济医院冯海忠研究员合作的最新研究成果“特异抑制自噬关键转录因子TFEB的小分子化合物研发”。这项工作首次报道了具有明确作用机理，高效抑制自噬关键转录因子TFEB（transcription factor EB）的小分子化合物。
北京大学生命科学学院胡家志实验室揭示转录调节DNA复制起始的分子机制（图）
北京大学生命科学学院 胡家志 DNA 复制 分子机制
2021/6/22
DNA是主要的遗传物质，也是中心法则的源头。DNA代谢包括DNA复制、转录及DNA修复等。其中，DNA复制保证了遗传信息精确完整地传递，而转录则是细胞身份维持和功能调控的关键。DNA复制发生在整个染色质上，而转录则只发生在染色质上的转录区。如果这两个关键的细胞过程碰撞，犹如独木桥上狮虎相遇，会发生什么呢？研究表明，DNA复制和转录在转录区域的相遇会产生大量的DNA损伤[1, 2]。为了尽量规避这种...
人类精子发生过程承载着将父源基因组遗传信息进行精准代际传递的任务，也是人类自身繁育和物种延续的重要保障。全世界约有10-15%的育龄夫妇存在不孕不育的问题，其中，男性因素约占50%左右。阐明人类精子发生过程中的基因表达调控机制是发育生物学的重大科学问题，对理解、诊断和治疗男性不育相关疾病至关重要。2018年8月30日，北京大学北京未来基因诊断高精尖创新中心、生命科学学院BIOPIC中心汤富酬课题组...
人类不同类型细胞中X-盒结合蛋白1转录活性研究
转录因子 XBP1启动子 CAT ELISA 转录调控
2008/1/24
摘要人类X-盒结合蛋白1（X-box binding protein1，XBP1）作为一种重要的转录因子，在细胞中涉及了广泛的信号调控过程。为进一步研究XBP1的生物学功能，首先利用生物信息学技术确定XBP1基因的启动子区域和2个缺失突变体的基因序列，聚合酶链反应扩增XBP1启动子和2个缺失突变体的基因序列，分别克隆至真核报告载体pCAT3-Basic中，构建3个报告载体p1- XBP1p、p2-...
人多肽链延伸因子1α四个反转录假基因的鉴别与定位
多肽链延伸因子1α 反转录假基因 定位
2008/1/7
人多肽链延伸因子1α基因EEF1A是一个在蛋白质合成过程中起重要作用的看家基因。通过对已有GenBank、GDB等数据库的综合分析,鉴别了4个人类多肽链延伸因子1α基因的反转录假基因,并分别将其精细定位于4q2 5、7p15-21、9q34和19q13上。
真核基因体外转录
2008/1/5
摘要 基因表达和它的调控是有机体生命现象的基础,如细胞生长和分化,发育,肿瘤形成和各种遗传疾病的发生,无不与基因的表达和调控有关、基因表达的调控可以在不同的水平上进行,转录水平上基因表达的调控可说是最重要的阶段,为此弄清遗传信息在转录水平上表达的机制将大大有助于阐明各种生命现象的本质。原核基因的转录机制目前了解得较清楚,
摘要 本文用含有人工合成28肽心钠素基因质粒的大肠杆菌(TAP106-pYX40),分别进行温度诱导和丝裂霉素C诱导,提取菌体中的总RNA,与γ-~(32)P标记的心钠素基因片段进行RNA打点杂交,并通过测定杂交阳性信号的总灰度值(Totalgray value),建立了人心钠素基因特异mRNA相对定量方法,从而观察到温度诱导对P_L启动子控制下的心钠素基团转录发生得慢,特异的mRAN产量较低,但...
人SATB1基因5′上游序列的转录激活功能分析
SATB1基因 启动子 报告基因分析 转录调控
2007/12/24
在对人SATB1基因进行生物信息学分析的基础上 ,采用PCR技术 ,扩增人基因组DNA中SATB1基因 5′上游序列的 - 2 95 5～ - 9片段 ,构建了 3个分别由SATB1基因 5′上游 - 2 95 5～ - 9,- 172 7～ - 9和 - 76 0～ - 9序列片段驱动的报告载体 -pGL3 SP2 94 6 luc ,pGL3 SP1718 luc和pGL3 SP75 1 lu...
摘要 为了克隆人高亲和力钠离子依赖性二羧酸转运蛋白 (highaffinitysodium dependentdicarboxylatetransporter,SDCT2 ,或NaDC3)基因并研究其生理功能 ,用大鼠SDCT2基因序列作为电子杂交探针对人EST数据库进行电子筛选 ,得到了一系列与大鼠SDCT2序列具有高度同源性的人EST序列 ,将它们拼接成 2个基因重叠群 ,设计特异性PCR引物...
基于RefSeq数据库的人类标准转录数据集的构建
RefSeq数据库 转录组 质量控制 人类标准转录数据集
2007/12/21
美国国家生物信息技术中心(NCBI)提供了具有生物意义上的非冗余的基因和蛋白质序列的RefSeq参考序列数据库。然而，由于基因普遍存在的多态性以及不同实验室对于序列测定的质量控制存在差异等原因，已发现RefSeq数据库可能存在部分质量问题。文章基于“中心法则”提出“标准转录数据集”的概念，以人类基因和基因组序列为例，利用BLAT、Sim4和自行设计的EIparser等基因结构解析程序分析了Re...
NF-κB结合位点在LPS诱导人TNF-α基因转录中的调节作用
核因子κB 肿瘤坏死因子α 萤光素酶报道基因 内毒素
2007/12/20
摘要 为探讨人TNF α基因启动子区域NF κB结合位点对LPS诱导性基因表达的调节作用 ,将构建的含人TNF α基因启动子区域及其不同缺失片段的pGL2萤光素酶报道基因重组体 ,体外转染HL 60细胞 ,观察LPS刺激对TNF基因启动子指导萤光素酶表达的影响 .发现TNF α基因启动子区域的 3个NF κB结合位点的存在是该基因最大组成性表达和LPS诱导性表达所必需 ;将这 3个位点缺失可完全阻...
转录因子NF-κB p50基因的克隆、表达及抗p50抗体的制备
ＮＦ－κＢ ｐ５０基因 基因重组 抗ｐ５０抗体
2007/12/19
摘要 利用ＤＮＡ重组技术，将转录因子ＮＦ－κＢｐ５０基因片段插入ｐＧＥＸ－２Ｔ质粒载体，经ＤＮＡ序列分析证明克隆的正确性．将重组的ｐＧＥＸ－２Ｔ／ｐ５０转化入大肠杆菌ＪＭ１０９，表达出ｐＧＥＸ－２Ｔ／ｐ５０融合蛋白．经ＷｅｓｔｅｒｎＢｌｏｔ检测证实表达产物对抗ｐ５０ｃ的抗体呈特异性反应，表明克隆的正确性，并成功地应用纯化的ｐ５０蛋白制备了免疫血清．为进一步对ＮＦ－κＢ的功能进行研究打下了良好的基础...
PKC对人mdr1基因转录调控的研究
ＰＫＣ ｍｄｒ１基因 转录调控
2007/12/18
摘要 研究了ＰＫＣα、β１和β２亚型对多药耐药基因ｍｄｒ１转录的调控作用．以ｍｄｒ１基因上游调控序列驱动的虫荧光素酶报告基因表达载体和ＰＫＣ基因表达载体共同转染ＣＯＳ７细胞后，测定虫荧光素酶报告基因表达水平．实验结果表明，ＰＫＣα、β１及β２对ｍｄｒ１基因的转录有下调作用，ＰＭＡ可进一步加强这一作用；在此转染体系中，ＰＫＣ抑制剂ｓｔａｕｒｏｓｐｏｒｉｎｅ也可抑制ｍｄｒ１基因的转录，但在只转染ｍｄｒ...
应用RT-PCR检测基因的体外转录活性
体外转录 ＲＴ－ＰＣＲ 基因转录调控
2007/12/18
摘要 体外转录分析已广泛应用于分子生物学领域．由于体外转录所产生的ＲＮＡ的量极少，需有灵敏的方法检测生成的ＲＮＡ．本研究发展了一种基于ＲＴ－ＰＣＲ技术鉴定体外转录产物的方法．将待研究基因的启动区与任何一段已知的含转录起始位点的编码序列相连，制备成体外转录的模板．体外转录后，用ＤＮａｓｅⅠ将ＤＮＡ模板完全降解；生成的ＲＮＡ经反转录合成ｃＤＮＡ；再以ｃＤＮＡ为模板，用相应的引物进行ＰＣＲ扩增，产物用琼...