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rDNA-ITS序列鉴定深部真菌菌种的研究进展
ITS区 鉴定 深部真菌
2012/8/9
目前深部真菌病的发生率呈逐渐上升趋势,有关深部真菌菌种的鉴定成为研究热点。由于传统的菌种鉴定方法存在费时及易受实验条件影响等不足,核糖体rDNA-ITS序列分析法已越来越广泛的应用于真菌属内不同种间的系统发育研究中。本文综述了核糖体rDNA-ITS鉴定深部真菌菌种的研究进展,展望了其应用前景。
金黄壳囊孢菌 rDNA ITS序列测定及生理学特性
金黄壳囊孢菌 培养特性 rDNA ITS序列 物候期
2011/8/17
通过在实验室内培养杨树烂皮病菌金黄壳囊孢菌菌株CC1,确定了其孢子萌发有一定的物候期,产孢规律与自然条件下杨树烂皮病的发病季节一致,其菌丝生长不随季节的变化而变化。菌株CC1的生长最适温度30℃,最适pH值为5~6,最适碳氮源分别是葡萄糖和蛋白胨。最适培养基配方:马铃薯200 g,蔗糖20 g,酵母膏2 g,蛋白胨2 g,硫酸镁0.5 g,磷酸二 氢钾1.5 g,维生素B1 100 mg,琼...
16S rDNA同源性所揭示的双歧杆菌与有关细菌的亲缘关系
双歧杆菌 16S rDNA同源性 系统发育
2009/9/10
本研究测定了低GC含量的双歧杆菌(Bifidobacterium inopinatum)和新种B.thermacidophilum的16SrDNA全序列,在同另外19个双歧杆菌及 8个相关细菌的16SrDNA同源性分析的基础上构建了系统发育树。结果表明:除低GC含量的B.inopinatum外,所有双歧杆菌的种在16S rDNA序列相似性≥92%的水平上聚类为一个簇群。尽管B.inopinatu...
采用基于16S rDNA 的变性梯度凝胶电泳(denaturing gradient gel electrophoresis, DGGE)和16S rDNA文库序列分析的手段,研究了重要经济昆虫家蚕Bombyx mori 2个品系——专食性品系C108和广食性品系SCN2幼虫中肠内的细菌群落多样性,同时还探讨了食料对家蚕中肠内细菌群落结构的影响。文库序列分析表明,PCR 扩增得到的16S rDNA...
摘要:土壤微生物多样性是土壤生态功能的基础, 但长期以来缺乏对高强度土地利用条件下的土壤微生物多样性的认识。作者采用间接法提取了江苏省太湖地区典型菜地土壤微生物的总DNA, 以细菌的通用引物27F和1492R扩增16S rDNA片段, 将扩增产物与T-载体酶连, 转化大肠杆菌, 建立土壤微生物16S rDNA克隆文库。PCR扩增基因文库中插入的16S rDNA外源片段, 用两种限制性内切酶Hha ...