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基于SVM方法分析蛋白酶体裂解位点的特异性
支持向量机 蛋白酶体 抗原肽
2009/10/13
真核细胞中的泛素-蛋白酶体系统在抗原肽加工呈递途径中发挥着重要作用. 为了进一步研究蛋白酶体的酶切位点特异性, 采用支持向量机(support vector machine, SVM)方法建立了蛋白酶体的酶切位点预测模型. 在相同检验集下, 将本模型性能指标与其他预测模型方法比较, 结果是本模型性能指标优先, 预测准确度为83.1%. 由样本数据相应氨基酸对酶切位点形成的权重系数, 得出蛋白酶体酶...
预测物种潜在分布区——比较SVM与GARP
2007/8/29
摘要物种分布与环境因子之间存在着紧密的联系,因此利用环境因子作为预测物种分布模型的变量是当前最普遍的建模思路,但是绝大多数物种分 布预测模型都遇到了难以解决的“高维小样本"问题。该研究通过理论和实践证明,基于结构风险最小化原理的支持向量机(Support vector machine, SVM)算法非常适合“高维小样本"的分类问题。以20种杜鹃花属(Rhododendron)中国特有种为检验对象...