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肽段可检测性预测方法及系统,是中国科学院数学与系统科学研究院研发的一种蛋白质组学中利用深度学习预测肽段被质谱检测可能性的计算方法和系统。该方法对所有蛋白序列进行理论酶切,得到各理论酶切肽段;利用预先训练得到的基于肽序列的肽段可检测性预测模型(循环神经网络)确定各理论酶切肽段的第一可检测性概率,再结合预测的肽段酶切概率,确定肽段的最终可检测性。通过利用深度学习方法,以及融合肽段酶切概率,可以显著提高...
一种蛋白质无标绝对定量方法,是中国科学院数学与系统科学研究院联合中国人民解放军军事科学院军事医学研究院和北京蛋白质组研究中心研发的一种蛋白质组学中确定蛋白质绝对量的计算方法。该方法从筛选出的高可信蛋白质中选取出若干肽段作为高可信肽段,计算每一高可信肽段的物理化学性质及肽段定量效率;基于高可信肽段的物理化学性质和肽段定量效率,构建训练集;然后利用该训练集训练得到肽段定量效率预测模型;利用所述肽段定量...
种蛋白质组学中肽段的肽段定量效率预测方法,是中国科学院数学与系统科学研究院联合中国人民解放军军事科学院军事医学研究院和北京蛋白质组研究中心研发的一种蛋白质组学中预测肽段质谱定量效率的计算方法。质谱实验中相同浓度的肽的质谱信号强度往往存在很大差异。目前,蛋白质定量分析通常采用对肽质谱强度取平均的策略,由于肽质谱强度的测量误差非常大,这种策略只有当肽的数量很大时才有效,但是肽的数量通常较小。为了提高蛋...
一种基于子集错误率估计的肽鉴定方法,是中国科学院数学与系统科学研究院研发的一种蛋白质组学中肽鉴定的质量控制方法。在相同的打分阈值下,修饰肽鉴定和非修饰鉴定的FDR是不同的。所以,如果修饰鉴定的FDR必须分开单独估计。但是,当要鉴定的修饰丰度较低时,由于数据样本量不足,直接从数据(如用目标-诱饵库搜索方法)估计修饰鉴定FDR会严重失真。基于对实际的数据观察分析,提出了一种错误鉴定为修饰鉴定的条件概率...
以小麦麦醇溶蛋白(WG)和青麦仁麦醇溶蛋白(GG)为原料,建立了小麦胶质蛋白改性技术,改性后的蛋白具有更好的溶解度、乳化特性、保水和保油特性、热稳定性和消化率。利用绿原酸(CA)和木犀草素(LU)共价偶联降低小麦麦胶蛋白(Gli)的致敏性,改善小麦麦胶蛋白(Gli)功能特性,建立具有良好热稳定性、抗氧化活性和体外消化性能Gli-CA/LU复合物制备技术。酶解制备咸味肽技术,建立了小麦咸味肽的制备和...
认识幽门螺杆菌     幽门螺杆菌  致癌因子  十二指肠       2024/2/27
幽门螺杆菌1994年被世界卫生组织列为Ⅰ类生物致癌因子,2017年再次被列为Ⅰ类致癌原,由此引起了大众前所未有的焦虑,往往“谈菌色变”,惶惶不可终日。今天我们一起来认识一下幽门螺杆菌。
近日,中国科学院广州生物医药与健康研究院研究员刘晶团队联合西湖大学教授裴端卿等,揭示了碱基类似物溴脱氧尿苷(BrdU)和碘脱氧尿苷(IdU)通过DNA损伤修复途径调控组蛋白乙酰化和DNA去甲基化从而促进体细胞重编程的分子作用机制,同时在多个重编程系统中验证并发现了其剂量与作用结果之间的相关性。相关成果发表于《细胞与生物科学》。
即使在新冠疫情期间接种了数十亿剂疫苗后,信使核糖核酸(mRNA)疫苗仍令人惊讶。近日,《自然》发表的一项研究表明,mRNA疫苗可能会促使细胞产生少量意想不到的蛋白质。研究人员提出一种解决方案,有助于使未来基于mRNA的疫苗或药物更安全、更有效。
2023年12月22日,复旦上医徐彦辉团队在《科学》(Science)杂志上在线发表题为“Structural visualization of transcription initiation in action”的研究长文(Research Article)。该项研究首次用结构重现出了转录从头起始的16个连续动态全过程,揭示了通用转录因子(GTFs)和转录泡协同RNA聚合酶Pol II调控转录...
近日,中国科学院广州生物医药与健康研究院研究员郑辉团队联合西湖大学教授裴端卿研究揭示了维生素C通过其代谢物2,3-二酮-L-古洛糖酸(DKG)依赖和非依赖的双重途径调控体细胞重编程的作用机制。相关成果发表于Cell & Bioscience。
中国科学院南海海洋研究所研究员徐向荣团队在河口食物网抗生素结合态代谢物的生物富集机制研究方面取得新进展,首次证实了结合态抗生素在河口食物网的传递规律。近日,相关成果发表于《危险材料杂志》。
人们常说适量喝点红酒有助于身体健康,但不是每个人喝完红酒都感觉良好,有些人即使喝少量红酒也会引起头痛。通常情况下,这种头痛会在喝了一小杯红酒后的半小时到3小时内发生。
兰州大学《生物化学实验》建课于1979年,在老一辈生物学家的关心和支持下,为课程的发展奠定了基础。本课程旨在训练学生基本的生物化学实验方法和技术,熟练掌握蛋白质、酶、糖、脂质、核酸等生物分子的提取、分离、纯化,以及定性、定量分析技术。近20多年来,在课程负责人沈剑敏老师带领下,始终致力于课程建设,从1993年成为国家理科基地主干课程,2006年成为国家级实验教学示范中心专业核心课程,2022年建成...
在早期阶段,淀粉样蛋白如果不能被特殊的酶清除干净,后期就会形成斑块。随着时间的推移,这些斑块随后会触发一系列致命反应:它们引发神经炎症并产生大量的毒性tau。这一连串的反应会导致神经元死亡。阿尔茨海默病患者死后,从尸体脑中可以发现这些斑块。
近日,南方医科大学基础医学院教授白晓春/崔忠凯团队在关节腔内药物缓释延缓骨关节炎进程及临床转化探索方面取得新进展。相关成果发表于Journal of Nanobiotechnology。

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