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南京农业大学专利：一种基于转录组测序开发山茶属植物SSR引物的方法
南京农业大学 转录组测序 山茶属植物 SSR引物
2023/12/5
本发明提供一种基于转录组测序开发山茶属植物引物的方法：以茶树叶片为材料进行cDNA库的构建和illumina测序，经过滤和从头组装后获得转录组数据。使用MISA、SSR Hunter完成位点搜索，并对包含SSR位点的序列进行生物信息学分析。以此为据进行SSR分子标记引物的开发，利用开发的引物对部分山茶属植物材料进行遗传多样性分析。本发明成功设计38对引物，经多态性筛选最终获得16对多态性引物，利用...
本发明公开鉴定扁桃种质资源的SSR分子标记引物组及其应用，SSR分子标记引物组由38对引物组成，利用38对引物进行扁桃遗传多样性分析。本文以扁桃幼果转录组测序数据为基础，对微卫星位点进行了挖掘、分析和评价，对微卫星引物进行了批量设计和验证，开发出了38对多态性引物，其中27对为高多态性引物，8对中等多态性引物，3对低多态性引物，说明利用扁桃转录组数据开发引物具有较强的可行性，并对新疆主产区扁桃种质...
与杨树木材密度、纤维性状相关的SSR分子标记
杨树 木材密度 纤维性状 SSR
2008/1/20
摘要通过对美洲黑杨（Populus deltoides）×青杨（P.catha yana）的68个F2、双亲及其4个F1无性系田间随机区组设计，5次重复，分析了与木材 材性有关的木材密度、纤维长、纤维宽以及微纤丝角等性状。结果表明：纤维长有明显的杂 种优势，控制该性状表现的基因之间具有正效应的互作；控制木材基本密度的基因之间具有 负效应的互作。结合SSR分子标记结果，采用单因素方差分析法进行标记与...
日本落叶松群体的叶绿体SSR分析Analysis of Genetic Structure in Population of Larix Kaempferi by Chloroplast SSR Markers
叶绿体微卫星 日本落叶松 单倍型 群体遗传结构
2008/1/8
摘要
利用叶绿体微卫星（cpSSR）分子标记对日本国内的7个日本落叶松（Larix kaempferi）群体遗传结构进行了研究。11对cpSSR引物中筛选出的3对多态性引物，共产生10个长度不同片段，在197个样品中组合出现10个不同的单倍型（haplotype）。各群体的单倍型差异较大。cpSSR基因座揭示了日本落叶松的遗传变异：平均等位基因数A=3.33，平均有效等位基因数NE=1.20，基...
1华中农业大学园林学院,武汉4300742中国科学院武汉植物园,武汉4300743信阳农业高等专科学校园艺林学系,河南信阳464000
摘要：本研究采用空间自相关分析方法对同域分布的中华猕猴桃(Actinidia chinensis)和美味猕猴桃(A. deliciosa)自然居群SSR遗传变异的空间结构进行了研究, 以探讨猕猴桃自然居群遗传变异的分布特征。选用的9对SSR引物在两物种中共扩增出...